Marvel's Ultimate Spider-Man

El equipo de Spider-Man investiga el nuevo escondite del Doctor Octopus, y confisca una caja que contiene varios frascos de fórmula a base de ADN de diferentes animales. El científico de S.H.I.E.L.D., el Dr. Curt Connors (cuyo brazo derecho tuvo que ser amputado después del accidente del Helicarrier) se inyecta con la fórmula que contiene ADN lagarto, y mientras se restaura con éxito el brazo, con el tiempo se convierte en un monstruo reptil irracional.

Electro, un villano con el poder de manipular la electricidad, toma el control de todos los dispositivos eléctricos en Nueva York y causa un apagón masivo (culpando a Spider-Man y su equipo). Sin poder comunicarse con S.H.I.E.L.D., Spider-Man y su equipo tienen que aprender a cooperar entre sí y derrotar Electro sin la ayuda de la tecnología.

Spider-Man y Power Man entran en conflicto con Rhino, un inmenso fuerte rinoceronte con temas de villano, que intenta robar los envíos de productos químicos de Oscorp. En la escuela, Peter y Luke notan que Flash Thompson (que dejó de abusar a Peter) está ahora abusando a un nuevo tímido compañero nerd llamado Alex, pero pronto descubren una conexión impactante de Alex con Rhino y las longitudes irán hasta con el fin de vengarse de Flash.

Ava está siendo atormentada por los recuerdos de su pasado y se esfuerza por mantener el control sobre su amuleto de White Tiger, volviéndose cada vez más agresiva y salvaje durante las sesiones de entrenamiento. Spider-Man intenta encontrar una manera de ayudarla, pero todo el equipo se pone en peligro cuando Kraven, el gran cazador obsesivo que mató al padre de Ava, aparece en Nueva York para reclamar el poder del amuleto para sí mismo.

El Escarabajo ataca el sitio de construcción de la nueva Helicarrier de S.H.I.E.L.D., por lo que Nick Fury ordena a Spider-Man y Hawkeye (miembro de los Vengadores) detenerlo, pero en su búsqueda una explosión daña uno de los lanza telarañas de Spider-Man, haciendo que el fluido de la telaraña se adhiera en el brazo de Hawkeye y dejándolos pegados. Spider-Man y Hawkeye deben aprender a dejar de lado sus diferencias y trabajar juntos para derrotar al Escarabajo.

Doctor Octopus reúne a Rhino, Kraven, Escarabajo, Lagarto y Electro, y atrae a Spider-Man a su laboratorio submarino bajo el río Hudson con el Dr. Connors como cebo. Spider-Man intenta evadir a los seis villanos y escapar de la base para que pueda llamar a su equipo de refuerzo.

Sólo cuando la vida de Spider-Man en Nueva York ha alcanzado un nuevo bajo histórico por J. Jonah Jameson (de una recompensa por desenmascararlo), es invitado por el alcalde de Boston para convertirse en superhéroe residente de la ciudad y la mascota del turismo (mudándose a otra ciudad, sin importarle a Nueva York). No mucho después de eso, sin embargo, Spider-Man tiene que lidiar con la Araña de Acero y un grupo de supervillanos acorazados llamados Boston Terroriers, pero luego las cosas cambian.

Peter contempla decirle a Harry sobre su doble vida como Spider-Man, y advertirle que el Duende Verde podría tenerlo como objetivo. El Duende secuestra a Peter y lo obliga a vincularse con una versión mejorada del simbionte Venom, que él se refiere como Carnage. Cuando Carnage ataca el apartamento de Harry, este toma el control del simbionte, se convierte en Venom y se dispone a acabar con el Duende Verde de una vez por todas.

El equipo de Spider-Man se prepara para albergar una fiesta sorpresa en la casa de Peter. Sin embargo, un intento por parte de Nova para apagar las secretas instalaciones de seguridad de S.H.I.E.L.D. para un poco de intimidad hace que el sistema se vuelva loco, mientras que Spider-Man también tiene que llegar a un acuerdo con el estado de sus compañeros de equipo como compañeros de hogar.

S.H.I.E.L.D. lanza su nueva nave, el Tri-Carrier, que es capaz de dividirse en tres naves separadas para distintas situaciones. En su primera misión, el segmento Astro-Carrier viaja a la luna en respuesta a una señal de socorro por J. Jonah. Jameson que a regañadientes le pide ayuda a Spider-Man para buscar a su hijo desaparecido, John Jameson en la luna. Una vez en la luna, el equipo de Spider-Man busca a John Jameson mientras también tiene que luchar contra el Hombre Lobo.

Spider-Man inventa el aracno-rastreador, un dispositivo de rastreo de alta tecnología que planea huir de villanos y lo actualiza con la tecnología de Industrias Stark sin el permiso de Tony, accidentalmente le da la capacidad de producir múltiples copias de sí mismo. Un descontento científico de Industrias Stark, Michael Tan, utiliza una máquina de su invención para separar sus átomos, y su conciencia toma control de los aracno-rastreadores, creando un enjambre viviente impulsado por el odio hacia Tony Stark.

Mientras buscan a Thor desaparecido en combate, el equipo de Spider-Man se convierten en versiones aparentemente infantiles de sí mismos por uno de los trucos de Loki. Nick Fury coloca al equipo de Spider-Man en la guardería del Tri-Carrier, pero con Thor, que también ha sido reducido, el equipo de Spider-Man debe encontrar una manera de vencer a Loki y la armadura Destructor y volver a su tamaño normal.

Después de ser atacado por un misterioso asesino, Danny es llamado de regreso a K'un-L'un (la antigua ciudad del Himalaya en el que se entrenó en las artes marciales y se convirtió en Puño de Hierro), y Spider-Man lo acompaña. Él tiene que tomar parte en un concurso para determinar al futuro rey de K'un-L'un, pero a medida que el veneno de la hoja del asesino lo ciega temporalmente, Spider-Man tiene que tomar su lugar en el concurso y competir contra un altamente cualificado pero arrogante guerrero conocido como el Escorpión.

Durante un experimento de S.H.I.E.L.D. para domar la furia de Hulk, Mesmero escapa con una venganza, intercambiando las mentes de Spider-Man y Hulk para otro ataque de diversión demente. Este dilema se ve seriamente agravado cuando la Mole, pensando que Hulk (Peter) está en un alboroto, también se une a la contienda.

Acompañados con S.H.I.E.L.D., Spider-Man ayuda a Power Man a descubrir lo que realmente pasó con sus padres. Ellos acaban descubriendo que fueron capturados por Escorpio y el Zodiaco para que puedan producir en masa el suero super soldado que dio a Power Man sus poderes, para su propio uso siniestro.

En una oscura noche, el Lagarto ataca la secundaria Midtown, con Spider-Man, Mary Jane, Harry y Stan el conserje adentro. Sin el apoyo de S.H.I.E.L.D., Spider-Man y Stan (quien comienza a demostrar cualidades ocultas) deben unirse para derrotar al Lagarto. Cuando por accidente hizo que desaparezca los rastros de Connors, volviéndose por completo el Lagarto.

Supervisor roba un archivo digital que contiene las identidades secretas de todos los superhéroes que trabajan con S.H.I.E.L.D., incluidos los de Spider-Man y sus compañeros de equipo. Frustrado por una reciente serie de desgracias y los exigentes horarios de entrenamiento de S.H.I.E.L.D., Spider-Man acompaña a Deadpool (un mercenario distraído que una vez entrenó con la agencia) en su misión de recuperar el archivo, pero pronto comienza a darse cuenta que Deadpool no es un verdadero héroe.

El Duende Verde es aprehendido por el equipo de Spider-Man y encarcelado a bordo del Tri-Carrier. Él deja el simbionte Venom suelto en la nave, y se separa en múltiples simbiontes que toman el control de la tripulación, la creación de un ejército de Venoms. Cuando el Duende se escapa de su celda y con el simbionte original, Spider-Man usa nuevamente la armadura de Araña de Hierro y tiene que formar una alianza incómoda con el Doctor Octopus para crear un suero que convertirá al Duende de vuelta a Norman Osborn.

Spider-Man acompaña a Nova en una aventura espacial para ayudar a sus mentores, los Guardianes de la Galaxia, para salvar la Tierra de Korvac y los Chitauri.

Cuando Arcade planea lanzar misiles nucleares para causar la Tercera Guerra Mundial, Spider-Man hace equipo con el Capitán América y Wolverine en el que terminan en Madland de Arcade que se encuentra en Madripoor.

En la noche de Halloween, el equipo de Spider-Man se encarga de la entrega de la mitad del Ankh de Tekamentep (un antiguo artefacto egipcio) al experto cazador de vámpiros Blade, pero son atacados por una armada de vámpiros enviados por Drácula, quien quiere usar el poder del Ankh para hacerse a sí mismo inmune a las debilidades de los vampiros como la luz solar. Una vez que el Ankh está seguro, Fury envía al equipo y a Blade para recuperar la segunda mitad del almacenamiento en un museo antes que Drácula pueda llegar a ella.

El Hombre de Arena regresa a la ciudad de Nueva York alegando que él ha dado vuelta a una nueva página y quiere convertirse en un héroe, mientras que todos los demás desestima esta nueva revelación de Spider-Man que ve esto como una oportunidad para reformar su antiguo enemigo en hacer el bien a pesar de que su nuevo amigo sigue la lucha de sus formas antagónicas.

Spider-Man forma una inverosímil alianza con un curado Norman Osborn en la armadura Iron Patriot para enfrentar a los Cuatro Terribles, cuando el Doctor Octopus ataca con un ejército de Soldados Arañas.

El Doctor Octopus y el Lagarto irrumpen en la Isla Ryker, una prisión para supervillanos, y liberan a Rhino, Electro, Kraven y Escorpión, equipándolos con armaduras de batalla hechas con tecnología robada de Oscorp. El equipo de Spider-Man y Iron Patriot pelean contra los Seis Siniestros, y mientras Spider-Man está determinado a inyectarle al Lagarto con una nueva formula que lo hará humano otra vez, pero el Doctor Octopus planea convertir a Norman Osborn de nuevo en el Duende Verde. Al final, después de que los Seis Siniestros son derrotados, el Duende se escapa y llevándose al equipo de Spider-Man.

Drácula ha obtenido ambas mitades del Ankh de Tekamentep y tiene bajo control mental a los compañeros de Spider-Man. Con el fin de detenerlo de activar el Ankh antes del amanecer, Spider-Man y Blade unen fuerzas con los Comandos Aulladores de Nick Fury (un grupo de trabajo formado por S.H.I.E.L.D. consistido por varios monstruos heroicos) y viajan al castillo de Drácula para recuperar el Ankh. Sin embargo, las cosas se complicarán aún más.

Después de la pelea con los Seis Siniestros, el Lagarto ha vuelto a ser el Dr. Connors pero Norman Osborn ha sido transformado en el Duende Verde otra vez y ha capturado al equipo de Spider-Man (quienes han sido previamente derrotados por los Seis Siniestros). El Duende Verde ha transformado a sus amigos y planea usar el viejo Helicarrier para esparcir su gas a Nueva York. Pero usando el suero del Dr. Connors, Spider-Man vuelve a la normalidad a su equipo y vencen al Duende Verde, pero el Dr. Connors dice que es imposible curarlo nuevamente. Por su acto de heroísmo, Fury invita a Iron Man, Thor y al Capitán América que le ofrecen a Spider-Man un puesto en Los Vengadores.

Spider-Man ayuda a una chica llamada Daga quién busca a su compañero llamado Capa, de ser amenazado y controlado por un ser diabólico llamado Dormammu, que capturó no solo a Capa, sino a sus compañeros White Tiger y Puño de Hierro, y también al Dr. Extraño quienes pedían su ayuda y le da a Spider-Man su amuleto ojo místico dándole poderes de él. Al encontrarlos, los liberan del control de Dormammu (Daga les dio una nueva apariencia de los trajes de White Tiger y Puño de Hierro) y al derrotarlo, Spider-Man quiere reclutar a Capa y Daga como nuevos miembros de su equipo de S.H.I.E.L.D., pero ambos están debido a su alineación leal en secreto con el Supervisor.

Mientras que Peter muestra la armadura de la Araña de Hierro hecha en Industrias Stark, a sus compañeros de clase en la feria de ciencias de su escuela para la caridad, un intelectual de 13 años, su rival, Amadeus Cho también está observando el traje y tras una serie de eventos, alcanza y perfectamente opera la armadura Araña de Hierro en hacer a Spider-Man aún más envidia de Cho (teniendo en cuenta que nunca pudo controlar la armadura que así, para empezar).

Una criatura que se hace llamar el Buitre está causando problemas. Spider-Man intenta atraparlo, que una vez fue un sujeto de prueba del Doctor Octopus y se va donde Harry Osborn para obtener información sobre su pasado. Después le impide asesinar a Harry y convenciéndole de que su amigo es inocente de lo que le ocurrió, Spidey trata de ayudar al Buitre de asistir en la recuperación de su memoria mediante la liberación del Doctor Octopus desde su celda en busca de respuestas.

Spider-Man viaja a La Tierra Salvaje de la Antártica con Wolverine para hallar a un nuevo héroe, Ka-Zar. Las cosas se complican a causa del plan de Supervisor y Kraven, que buscan a Ka-Zar y Zabu, su mascota tigre dientes de sable (un hermano para él), que fue capturado por su cuenta. Pero luego, Kraven le inyectó veneno a Spider-Man convirtiéndose en un monstruo arácnido, lo cuál tuvieron que improvisar para curarlo antes de perseguir al Supervisor y Kraven, para salvar a Zabu (Kraven intenta sacrificarlo para un ritual de la inmortalidad).

Ahora que los otros jóvenes héroes se han reunido, Spider-Man debe conducirlos a la defensa del Tri-Carrier de los Thunderbolts (que consisten en Supervisor, Buitre y Capa y Daga) donde lograron liberar al Duende Verde, el Doctor Octopus, Escarabajo y Escorpión de sus celdas. Pero, después de la batalla, solamente 2 del Supervisor, Capa y Daga se unieron a Spider-Man de haber salvado a uno de ellos y descubrir la verdad. Pero al vencer a los villanos, el Duende Verde escapa, llevándose un objeto mágico (que Dormmamu lo usaba para ir a varios universos, cuando Spider-Man lo obtuvo y dándoselo a S.H.I.E.L.D.).

Spider-Man se entera de que el Duende Verde está planeando viajar a través del Spider-Verse, usando el Sitio Peligroso que le robó a S.H.I.E.L.D. y con la energía de Electro para recoger el ADN de otros Spider-Men. Spider-Man sigue a su enemigo en el mundo futurista de Marvel 2099 (que se dibuja en CGI) y ayuda a aumentar la confianza del Spider-Man 2099. Luego viaja a un universo intercambiado en el género y se une a Spider-Girl para derrotar a su versión femenina del Duende Verde.

Mientras que persigue al Duende Verde en todo el multiverso, Spider-Man llega en el universo Marvel Noir donde conoce a Spider-Man Noir que lo ayuda a renovar su amistad con Mary Jane. Entonces Spider-Man se dirige a un mundo de dibujos animados habitado por animales antropomorfos donde anima a Peter Porker de no dejar de ser un superhéroe y lo ayuda a recuperar su voluntad de convertirse en Spider-Ham.

Como Spider-Man sigue persiguiendo al Duende Verde en todo el Multiverso, aterriza en un mundo medieval, con base en donde ayuda a Spider-Knight de acabar con el Alquimista (la versión medieval del Doctor Octopus) y su creación Kraken para salvar York. Entonces, su última parada antes de volver a casa va a una versión alternativa del Universo Ultimate donde ayuda a Miles Morales como el nuevo Spider-Man de superar la culpa de no poder salvar al Peter Parker de su mundo, en su muerte y lucha contra el Ultimate Duende Verde. Pero luego, el Duende Verde también descubrirá la verdad de Spider-Man.

Después de que Spider-Man finalmente termina en su propio universo, se encuentra con el Duende Verde (que descubrió la identidad de Spider-Man) que se ha inyectado a sí mismo con el ADN de los Spider-Men de todos los universos para convertirse en el Duende Araña. Pero con la ayuda de Electro en el Sitio Peligroso, convoca a todos los Spider-Men de sus universos para ayudar a Spider-Man, formando la Red de Guerreros para luchar contra el Duende Araña, incluso cuando Electro planea destruirlo. Después de volverlo a la normalidad, Electro sale libre convirtiendo el antiguo Helicarrier en un gigantesco robot estando adentro para destruir la ciudad de Nueva York, lo cuál, la Red de Guerreros también deberán detenerlo.

La Academia S.H.I.E.L.D. se ha abierto en el Triskelion por Nick Fury, como Spider-Man y todo su equipo consiguen su educación del señor Robert Frank y otros profesores invitados como el Capitán América y Hawkeye. A mitad de camino en su educación, Spider-Man y Araña de Hierro, sin saberlo, reactivan a un viejo villano de la Segunda Guerra Mundial llamado Arnim Zola.

Cuando Rhino se entera de que su archienemigo Flash se ha convertido en un héroe, comienza un alboroto amarga a través de Nueva York. Ahora Spider-Man y el Agente Venom son la última línea de defensa, junto a Hulk para que los ayude. Sin embargo, Hulk y Rhino se enfrentan en batalla, y solo Spider-Man y el Agente Venom los deben detener ahora, para que no causen alborotos. Pero al estar herido, el Agente Venom, Spider-Man usa una nueva armadura, Iron Spider Hulkbuster, creada por el Dr. Connors. Al detenerlos, Spider-Man razona con Rhino para que no se sienta mal de su abuso como les paso a otros (revelándole su identidad) y que use su fuerza para el bien, y deciden reformarlo en la academia S.H.I.E.L.D., ¿será cierto?

Nick Fury ha sido infectado por versiones nanites del Doctor Octopus como Octo-bots de búsqueda. Mientras que los otros se enfrentan contra el Doctor Octopus, Spider-Man y Power Man trabajan con Ant-Man para entrar en el cuerpo de Nick Fury y detener a los Octo-bots en su búsqueda, con la ayuda de Araña de Hierro crea un submarino especial (y le da también un nuevo traje a Luke).

Ansiosos por la comida mexicana después de un entrenamiento de todo el día con Hawkeye, Spider-Man, Power Man y Chica Ardilla van a escabullirse del Triskelion después de unas horas por burritos nocturnos. En el camino, tienen que lidiar con la trampa de Mesmero de utilizar la red celular para lavar el cerebro a todos como lo hizo con Batroc El Saltador, Boomerang, Grizzly y Shocker.

Después de la pelea de Spider-Man con Molten Man, los Inhumanos han declarado la guerra a Manhattan como Nick Fury culpa al estudiante de intercambio, Tritón. Spider-Man y Tritón descubren que Maximus ha lavado el cerebro al resto de la Familia Real de Inhumanos (que consta de Black Bolt, Medusa, Gorgon, Lockjaw y Karnak) y los planes para chocar Attilan en Manhattan.

Arnim Zola regresa y ha sustituido a los compañeros héroes de Spider-Man y al personal de S.H.I.E.L.D. en el Triskelion con versiones sintezoides de ellos. ¿Quién puede confiar en Spider-Man para ayudar a salvar la Academia?

Con la mayoría de sus compañeros de estudios reemplazados por sintezoides, Spider-Man debe trabajar con el Agente Venom y Rhino para rescatar a sus compañeros de clase y derrotar a Arnim Zola.

Spider-Man, los Vengadores y los Agentes de S.M.A.S.H. luchan contra sus mayores enemigos por el destino del planeta. Al encontrar la gente de Nueva York que desapareció y un campo de fuerza alrededor de la ciudad, Spider-Man es atacado por Abominación, Escarabajo y Skurge, hasta que es salvado por un avión no tripulado familiar. Spider-Man descubre que ha sido elegido para ser el jefe de pieza de juego del Coleccionista (requiriendo su ayuda) contra su hermano, el Gran Maestro que trata de someter la Tierra y una vez más humillar a su hermano.

En el segundo juego en la ciudad, Spider-Man se une con el Capitán América, Hulk Rojo y Puño de Hierro en un juego de capturar la bandera contra el Hombre de Arena, Blastaar e Ymir. Para el tercer juego, Spider-Man se une también con Power Man, Black Widow y Skaar contra el Doctor Octopus, Hombre Absorbente y Zzzax en un juego del último equipo en pie, pero las cosas se convierten en un problema cuando el Gran Maestro empieza a cambiar el ambiente del juego, como inundar la ciudad y llenarla con tiburones.

Para el cuarto juego, Spider-Man se une al Agente Venom, Araña de Hierro y Thor contra Annihilus, Terrax y Attuma en una pelea por el metro. Furtivamente lejos de la batalla, Spider-Man obtiene algunos modelos robots LMD de S.H.I.E.L.D. y los utiliza para distraer al Gran Maestro para que él, Araña de Hierro y el Agente Venom puedan subir a la nave del Gran Maestro para salvar a los rehenes civiles. Mientras el Coleccionista convoca a A-Bomb, Hawkeye y She-Hulk a la batalla, Spider-Man, Araña de Hierro y el Agente Venom obtienen la ayuda poco probable de El Líder y M.O.D.O.K. para salvar a los rehenes civiles hasta su tía May (quién descubre la identidad secreta de Peter como Spider-Man. Flash (Agente Venom) y Amadeus (Araña de Hierro) también son conscientes de este hecho), pero ¿puede que su plan tenga éxito?

El Gran Maestro ha ganado el Concurso de Campeones y reivindica a Manhattan a los malos. Como Spider-Man libera cada superhéroe mientras que el Coleccionista se mantiene firme contra el Doctor Octopus, Skurge y el Hombre Absorbente, desafía al Gran Maestro que el ganador se lleve todo en combate, ¿puede ganar Spider-Man?

Ha pasado un tiempo desde que Peter Parker como Spider-Man salvo a la ciudad (al derrotar al Duende Verde, reclutar jóvenes héroes para S.H.I.E.L.D. y ganar el Concurso de Campeones (cuando su tía May, Flash Thompson (Agente Venom) y Amadeus Cho (Araña de Hierro) descubrieron su identidad)), toda su vida ha cambiado a su alrededor. Ahora, Spider-Man, Agente Venom y Araña de Hierro son capaces de detener al Doctor Octopus. Mientras que en el Tri-Carrier de S.H.I.E.L.D., Nick Fury nombra a Spider-Man como su instructor, pero el Doctor Octopus desata un Octobot en miniatura para introducirse en los nanobots de Enjambre donde empieza a remodelar el Tri-Carrier y Ock cambia a una nueva apariencia siniestra.

Al ser salvado por el misterioso Araña Escarlata, Spider-Man debe reunir a Araña de Hierro y al Agente Venom para luchar contra HYDRA, ahora aliado con 2 / 6s de los nuevos Seis Siniestros: Doc Ock y Kraven el cazador. Ock intenta convertir a Norman Osborn de nuevo en el Duende Verde, pero no, como Norman se había inmunizado a sí mismo con una fórmula para contrarrestar las transformaciones más atrás en su alter ego loco. Teniendo en cuenta el antídoto, Spider-Man y Araña Escarlata comienzan a revertir a los duendes HYDRA de volverlos a la normalidad. Como no pueden conseguir la conciencia de Zola fuera de la isla HYDRA, Araña de Hierro programa los motores a conducir la nave profundamente en el espacio, donde Zola nunca será capaz de molestar a ellos de nuevo. Mientras tanto, Ock se escapa con Kraven para continuar la reconstrucción de los Seis Siniestros.

Por orden de HYDRA, los equipos del Doctor Octopus se unen con el Barón Mordo para utilizar el Sitio Peligroso para traer al último Duende Verde del mundo de Miles Morales para unirse a los Seis Siniestros. Por desgracia, este Duende es mucho más loco el de su dimensión, ya que roba el Sitio Peligroso y comienza destruyendo la realidad; Mordo se destruye en alboroto del Duende. Miles es traído por el Doctor Extraño para ayudar a combatir el Duende Verde, lo que resulta en la destrucción del Sitio Peligroso; como resultado, tanto el Duende y Miles se encuentran atrapados en esta dimensión. Doc Ock logra convencer al Duende Verde en aliarse con él y los Seis Siniestros, mientras que Miles se une a la Red de Guerreros de Peter.

Ajustándose al mundo de Spider-Man, Miles Morales trabaja en el desarrollo de un nuevo nombre en clave desde que Peter Parker sigue utilizando el nombre de Spider-Man. Ellos dos se tropiezan con una parcela por el Doctor Octopus y un Buitre blindado van en marcha para atacar a Oscorp con el fin de acceder a los equipos para que Buitre pueda aprender más acerca de su pasado. Spider-Man y Miles ayudan a Norman Osborn en la armadura de Iron Patriot a luchar contra el Doctor Octopus y el Buitre.

Cuando Spider-Man escuchó al Buitre que le dice que hay un espía de Ock entre los otros héroes, él y la Red de Guerreros asumen el nuevo programa de formación que fue instalado por Leo Fitz y Jemma Simmons, que empieza a estropearse. Posteriormente, Spider-Man, Araña de Hierro, Chico Arácnido y Araña Escarlata encuentran al Dr. Connors que se ha transformado en el Lagarto de nuevo, pero que ahora tiene una mordedura contagiosa que convierte a otros en lagartos como él.

Después de que el Doctor Octopus y Rhino han escapado del Triskelión con el Agente Venom en sus garras, Spider-Man y Araña Escarlata los siguen a la Isla HYDRA que regresó, como el Doctor Octopus y Arnim Zola que trabajan para separar el simbionte Venom de Flash Thompson. Con el fin de llegar a Flash, Spider-Man y Araña Escarlata tienen que luchar su camino más allá de Kraven el cazador y los agentes de HYDRA.

Spider-Man, Araña de Hierro, Agente Venom, Chico Arácnido y Araña Escarlata han estado buscando señales en donde se esconde el Doctor Octopus. Como Spider-Man y Araña de Hierro persiguen al Buitre, su búsqueda los lleva a una isla cercana donde descubren que el Doctor Octopus ha capturado al Hombre de Arena y lo ha clonado a partir de sus muestras de arena a fin de encontrar al "último Hombre de Arena" que se uniera a los Seis Siniestros. Después de que el Hombre de Arena es rescatado y el Doctor Octopus escapa, Spider-Man permite al Hombre de Arena para extenderse alrededor del Triskelion.

Spider-Man y el Agente Venom han tomando medidas para vencer a los posibles reclutas de los Seis Siniestros como Shocker, Shriek, Grizzly y Escarabajo. Arnim Zola recluta al Dr. Michael Morbius para trabajar en un nuevo simbionte. Cuando Spider-Man, Agente Venom y Harry Osborn en la armadura del Patriota en encontrarlos, son atrapados bajo la guardia cuando liberen el simbionte Anti-Venom que posee a Harry y no tiene ninguna de las debilidades del simbionte.

Durante una sequía, Spider-Man, Araña de Hierro, Chico Arácnido y Araña Escarlata responden a una señal de socorro que los lleva a un centro comercial abandonado en Queens. Ellos encuentran una sala de vacío hermético que contiene a Hydro-Man que tiene un pasado con Nick Fury. Si bien transportándolo al Triskelión, Araña de Hierro encuentra que Hydro-Man no es un buen tipo, donde la lucha con él hace un aterrizaje de emergencia cerca de la casa de la tía May. Mientras que Spider-Man, Araña de Hierro y Chico Arácnido luchan contra Hydro-Man, Araña Escarlata trabaja para proteger la tía May que termina nombrarlo Ben.

Después de derrotar a Shriek, Peter Parker (Spider-Man) se une a Flash Thompson (Agente Venom), Amadeus Cho (Araña de Hierro), Miles Morales (Chico Arácnido) y Ben Reilly (Araña Escarlata) para la fiesta de cumpleaños de la tía May. Las cosas se ponen peor cuando el Doctor Octopus completa a sus nuevos Seis Siniestros al unir a Kraven el Cazador, Ultimate Duende Verde, Rhino, Hydro-Man y Electro, donde atacan al Triskelion. Aún cuando la mayoría de los Seis Siniestros son derrotados por los estudiantes de la Academia S.H.I.E.L.D., Spider-Man se tomó por sorpresa cuando se da cuenta de que hay un séptimo miembro del grupo del Doctor Octopus, que Spider-Man sabe que es menos sospechoso, y era Araña Escarlata, que revela la identidad secreta de Spider-Man al Doctor Octopus.

Ahora que el Doctor Octopus sabe que Spider-Man es Peter Parker, envía a Araña Escarlata para reclamar la clave que Spider-Man ocultó en la casa de su tía May. Como el Doctor Octopus convierte la Isla HYDRA en la Isla Octopus con su nano-tecnología, mientras que atrapó a Arnim Zola, Spider-Man llega ante Araña Escarlata antes de que pueda dañar a la tía May. Con el fin de hacer frente a Hydro-Man, Spider-Man ha despertado al Hombre de Arena para luchar contra él.

A medida que los estudiantes de la Academia S.H.I.E.L.D. y el Hombre de Arena están disfrutando de un partido de voleibol de playa, Spider-Man ve a Nova de estrellarse en el Triskelion. Antes de perder el conocimiento, Nova le da a Spider-Man una caja que se necesita para ayudar a rescatar a Nick Fury. En compañía de Tritón, Spider-Man va a la ciudad abandonada de los Inhumanos, Atarog. Al encontrarse con la precognitiva, Madame Web, Spider-Man y Triton descubren que Nick Fury es prisionero de Crossbones y los agentes de HYDRA con él.

Michael Morbius roba una muestra del simbionte del Agente Venom, como órdenes de Crossbones y el Doctor Octopus en experimentar con él, siendo encadenado por su traición. Como Spider-Man y el Agente Venom trabajan para recuperar la muestra de Venom, el experimento permite la reactivación del simbionte Carnage.

Después de la explosión, Carnage comienza a infectar a todo Manhattan. Spider-Man trabaja con el Capitán América para luchar contra un Hulk Carnage-poseído, con la ayuda de Puño de Hierro, Capa y Daga y el Agente Venom (al ir por ayuda). Mientras tanto, Mary Jane trabaja para mantener a Harry Osborn seguro en un estado de coma, el contenedor estasis de Harry es violado por los Carnages y es despertado de nuevo como Anti-Venom. Incluso cuando Spider-Man y el Capitán América liberan también a Shriek y a los civiles del simbionte Carnage.

Tras el sacrificio del simbionte Anti-Venom, el simbionte Carnage se ha reformado en tamaño gigante y ha envuelto a la preparatoria Midtown. Como Spider-Man, Agente Venom y Harry Osborn como el Patriota de nuevo, luchan contra su camino más allá de los Mini-Carnages después de salvar a Stan fuera del edificio, se encuentran con su amiga Mary Jane Watson, que se ha convertido en la Reina Carnage, como Morbius el Vampiro (que ahora es casi-humano con alas de murciélago en la espalda) y Crossbones planean controlarla y usar los misiles confiscados por S.H.I.E.L.D. para enviar los drones Carnage a todas las ciudades del mundo.

Spider-Ham, Spyder-Knight, y la madre de Miles Morales, Rio aparecen de repente en la casa de Peter Parker. Al ser llevados a K'un-L'un por Puño de Hierro, Spider-Man y Chico Arácnido se reúnen con Nick Fury, el Doctor Extraño y Madame Web que afirma que la ruptura del Sitio Peligroso se dispersa en fragmentos de muchas dimensiones, y que si no se recogen a tiempo, muchos universos impactarán con otra, y finalmente, todos los universos serían destruidos. Utilizando un fragmento del Sitio Peligroso, Spider-Man y Chico Arácnido se van a un viaje a las diferentes dimensiones de recoger los fragmentos.

Ahora que Spider-Man y Chico Arácnido tienen que lidiar con Wolf Spider para llegar a los fragmentos del Sitio Peligroso, trabajan para encontrarlos antes de que Wolf Spider lo haga. Su siguiente parada es una dimensión pirata cuando Barba Web de temática pirata araña es persuadido por Spider-Man y Chico Arácnido en reunir a su equipo de animales (que consiste en versiones piratas de Howard el pato, Rocket Raccoon y Cosmo el perro espacial) para que se puedan enfrentar al Kraken en una versión barco pirata de Groot.

Volviendo a la realidad Noir, Spider-Man y Chico Arácnido se enredan con el Sr. Fixit (una versión Noir de Hulk) y sus subordinados Thunderbolt y A-Bombardier que están en una guerra de bandas con el Noir Hammerhead. Cuando Spider-Man Noir aparece, no quiere que Spider-Man y Chico Arácnido se interpongan a la desintegración de la guerra de bandas, porque desde la última vez que se vieron, perdió a Mary Jane en un accidente, y culpa a Sr. Fixit por ello.

Spider-Man y Chico Arácnido vuelven a la realidad de Chico Arácnido donde conocen a una versión de Spider-Woman como Gwen Stacy que ha estado cubriendo a Chico Arácnido con la ayuda de la tía May de este mundo, evadiendo los robots que trabajan para el capitán de policía, George Stacy. Cuando Wolf Spider se involucra mediante la celebración de Río Morales como rehén, Spider-Man, Chico Arácnido y Spider-Woman trabajan para detener a Wolf Spider donde descubren que es un Peter Parker malvado para drenar las energías de todos los personajes arácnidos.

En la noche de Halloween, Spider-Man intenta pedir dulce o truco cuando una extraña magia envuelve a Manhattan convirtiendo cada truco-o-tratador en lo que como ellos están vestidos. Spider-Man visita al Doctor Extraño que afirma que el hechizo responsable está en un nivel cuántico. Spider-Man y el Doctor Extraño terminan en el refugio de Ant-Man con el fin de ir al reino cuántico para encontrar la fuente del hechizo. Una vez allí, Spider-Man, Doctor Extraño y Ant-Man encuentran a un reensamblado Barón Mordo que ataca con ilusiones de Dormammu, Ultron y el Doctor Octopus mejorado con nanites, que es sólo el comienzo de su trama.

Mientras que está con Mary Jane Watson en el Central Park, Peter Parker encuentra un clon de Spider-Man que trata de alimentarse de ellos. Ellos observan al clon de uno de los laboratorios del Doctor Octopus donde encuentran información sobre el "Proyecto Kaine", que era una combinación de ADN de Spider-Man y los Sintezoides. Por sorpresa, Mary Jane usa a Carnage en su interior, convirtiéndose en Spider-Woman.

Debido a que Arnim Zola robó la investigación del Doctor Octopus; Araña Escarlata y Spider-Man tienen al Doctor Octopus que los llevara a la isla HYDRA hundida, donde Araña Escarlata quiere que la información de su pasado que también fue robada. Spider-Man, Doctor Octopus y Araña Escarlata luchan contra los Sintezoides Delta-Nueve, un equipo Spider-Slayer de híbridos Spider-Man/Sintezoide, consta con Bones-Spider, Goliat-Spider y Ghost-Spider. Los Sintezoides Delta-Nueve son parte del programa Arma S de Arnim Zola que fue creado como parte de Araña Escarlata. Las cosas se ponen peor cuando Arnim Zola vuelve a despertar. Mientras tanto, Mary Jane redondea al Agente Venom, Araña de Hierro y Chico Arácnido para reunirse con Spider-Man, mostrándoles su transformación como Spider-Woman. Araña Escarlata se revela como una araña sintezoide con demasiado ADN de Spider-Man.

Después de la lucha contra Arnim Zola; Spider-Man, Spider-Woman, Agente Venom, Araña de Hierro y Chico Arácnido traen a Araña Escarlata y los Delta-Nueve Sintezoides de nuevo al Triskelion donde tienen que detener a Nova, Power Man, Puño de Hierro y Chica Ardilla que se retiren debido a lo que ocurrió cuando saben que Araña Escarlata trabajó para el Doctor Octopus, por revelar la identidad de Spider-Man, de poner en peligro a la Academia S.H.I.E.L.D. y a la tía May, al estar todos en contra de él, que debe ser encerrado de por vida.

Después de la lucha contra Arnim Zola; Spider-Man, Spider-Woman, Agente Venom, Araña de Hierro y Chico Arácnido traen a Araña Escarlata y los Delta-Nueve Sintezoides de nuevo al Triskelion donde tienen que detener a Nova, Power Man, Puño de Hierro y Chica Ardilla que se retiren debido a lo que ocurrió cuando saben que Araña Escarlata trabajó para el Doctor Octopus, por revelar la identidad de Spider-Man, de poner en peligro a la Academia S.H.I.E.L.D. y a la tía May, al estar todos en contra de él, que debe ser encerrado de por vida.

Como Peter Parker se prepara para graduarse de la Academia S.H.I.E.L.D., es visitado por el Doctor Octopus, que amenaza con dañar a la tía May, si se pone el traje de Spider-Man de nuevo. Pero, Spider-Man se niega a estar de acuerdo y pone a la tía May bajo la protección de S.H.I.E.L.D. para capturar al Doctor Octopus con la ayuda de su equipo de Red de Guerreros y Nuevos Guerreros. Después de reunir a Escorpión, Kraven el cazador, Buitre y Rhino, así como a Crossbones en un nuevo Lagarto, el Doctor Octopus permite en ser encarcelados en Brig de la seguridad del Triskelion por el equipo de Spider-Man.

El campo de fuerza de contratación está empezando a acercarse a los graduados. Desesperado por detener a los Seis Siniestros y conseguir una charla de la tía May, Spider-Man consigue sus lanzaredes originales de vuelta con la tía May y va encabezando a Oscorp. Con la ayuda de Norman Osborn (al saber que Spider-Man es Peter Parker, recordando su memoria que fue antes el Duende Verde), Spider-Man es capaz de recuperar sus poderes con la araña radiactiva en el laboratorio oculto del Doctor Octopus y enfrentar a los Seis Siniestros cuando llegan a Oscorp, al percatarse de que Norman Osborn no estaba allí.